Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms