Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc52a2Q9D8F3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc52a2Q9D8F3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms