Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan13Q9D8C2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms