Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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