Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms