Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms