Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus10Q9D3U0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus10Q9D3U0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms