Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms