Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trappc6bQ9D289 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trappc6bQ9D289 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trappc6bQ9D289 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trappc6bQ9D289 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Trappc6bQ9D289 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms