Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkrip1Q9CWV6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms