Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms