Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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MINDY3Q9CV28 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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