Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms