Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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