Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms