Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms