Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Chmp3Q9CQ10 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Chmp3Q9CQ10 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Chmp3Q9CQ10 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Chmp3Q9CQ10 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Chmp3Q9CQ10 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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