Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Commd4Q9CQ02 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Commd4Q9CQ02 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Commd4Q9CQ02 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Commd4Q9CQ02 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Commd4Q9CQ02 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Commd4Q9CQ02 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Commd4Q9CQ02 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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