Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem2Q99NH8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trem2Q99NH8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem2Q99NH8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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