Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms