Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms