Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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