Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vps4aQ8VEJ9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms