Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmx1Q8VBT0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmx1Q8VBT0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms