Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms