Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms