Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rp1l1Q8CGM2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rp1l1Q8CGM2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rp1l1Q8CGM2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rp1l1Q8CGM2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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