Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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