Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp27Q8CEG8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms