Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc17Q8CE13 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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