Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc38Q8CDN8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc38Q8CDN8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc38Q8CDN8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms