Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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