Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp20Q8C6M1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp20Q8C6M1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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