Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms