Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP2

Ldhal6b, L-lactate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldhal6bQ8BVP2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldhal6bQ8BVP2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldhal6bQ8BVP2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms