Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab11fip4Q8BQP8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11fip4Q8BQP8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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