Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms