Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms