Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop53Q8BK35 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms