Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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