Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms