Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem39bQ810L4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem39bQ810L4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem39bQ810L4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms