Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc1Q80VQ1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms