Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pnma8aQ80VM8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma8aQ80VM8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms