Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Phf8Q80TJ7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Phf8Q80TJ7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Phf8Q80TJ7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Phf8Q80TJ7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Phf8Q80TJ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf8Q80TJ7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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