Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms