Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms