Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tfap2eQ6VUP9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms