Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms