Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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